Precalienta el horno a 425° F. Coloca el mirin y el sake en una cacerola pequeña y lleva a fuego medio durante 2 minutos. Añade el miso y revuelve hasta que esté suave. Agrega el azúcar y reduce a temperatura baja. Continúa cocinando, revolviendo de vez en cuando.
Unta los lados de las berenjenas con aceite de sésamo. Ponlas con la parte cortada hacia abajo en una bandeja para hornear y hornea de 15-20 minutos, dependiendo del tamaño de la berenjena, hasta que apenas comiencen a marchitarse y la carne esté tierna. Retira del horno y les das la vuelta.
Pon las berenjenas boca arriba con la salsa de miso y ponlas debajo de la parrilla hasta que la salsa se empieza a caramelizar, 1-2 minutos. Retira del horno y deja reposar por 5 min. Sirve con semillas de sésamo y las cebollas verdes.